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adf:pesofband [2022/01/20 20:22] – [前言] liu.jun | adf:pesofband [2022/12/14 11:16] (当前版本) – [前言] liu.jun | ||
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行 11: | 行 11: | ||
第一步,通过势能面扫描,观察H< | 第一步,通过势能面扫描,观察H< | ||
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+ | 实际上也可以做两轮NEB,代替此处的势能面扫描,得到过渡态结构的初始猜测。NEB过程,参考:[[adf: | ||
第二步,计算该过渡态初始猜测结构的频率(只需要计算与反应相关的少数几个原子的频率即可),然后进行过渡态结构优化,得到真正精确的过渡态,也就是能量的一阶梯度趋近于0(默认阈值0.001)。 | 第二步,计算该过渡态初始猜测结构的频率(只需要计算与反应相关的少数几个原子的频率即可),然后进行过渡态结构优化,得到真正精确的过渡态,也就是能量的一阶梯度趋近于0(默认阈值0.001)。 | ||
行 21: | 行 23: | ||
====第一步,创建二维MoS2==== | ====第一步,创建二维MoS2==== | ||
- | 打开ADFinput,点击窗口中上方的“ADF”,切换到“BAND”,这样左边窗口就是一个具有周期性的模型了,只是默认没有将晶格常数显示出来而已。先创建一个$MoS_2$模型,$MoS_2$在系统自带的数据库里面有: | + | 打开ADFinput,点击窗口中上方的“ADF”,切换到“BAND”,这样左边窗口就是一个具有周期性的模型了,只是默认没有将晶格常数显示出来而已。先创建一个MoS< |
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行 35: | 行 37: | ||
====第二步,创建超胞==== | ====第二步,创建超胞==== | ||
- | 创建超胞的目的,是为了降低表面$H_2$的吸附浓,否则默认一个原包吸附一个$H_2$,浓度太高了。超胞越大,浓度越低,当然计算量越大。这里,我们以2*2超胞为例,因为这样浓度不至于过高,超胞也不太大,计算量也不大。 | + | 创建超胞的目的,是为了降低表面H< |
- | 然后在$MoS_2$上方,画一个$H_2$分子即可。适当调整$H_2$的位置,使得其尽量接近将要发生反应的位置,也就是过渡态偏离反应物一端。当然这需要一些实际经验来判断。 | + | 然后在MoS< |
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