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adf:glasstmp

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adf:glasstmp [2021/11/09 11:50] – [三、提取密度-温度性质] liu.junadf:glasstmp [2024/05/28 13:01] (当前版本) – [四、计算玻璃化转变温度] liu.jun
行 9: 行 9:
   - 提取密度-温度性质   - 提取密度-温度性质
   - 计算玻璃化转变温度   - 计算玻璃化转变温度
-本计算对硬件要求较高,建议在集群或工作站上运行。+本计算对硬件要求较高,建议在集群或工作站上运行,软件版本要求AMS2021
 =====一、导入聚合物结构===== =====一、导入聚合物结构=====
 这里我们使用[[adf:cross-linkingratio|bond boost法]]生成的[[adf:coordinatsfrombondboost|交联环氧聚合物]],当然如果有其他结构的*.xyz文件,也可以直接通过AMSinput → File → Import Coordinates导入。 这里我们使用[[adf:cross-linkingratio|bond boost法]]生成的[[adf:coordinatsfrombondboost|交联环氧聚合物]],当然如果有其他结构的*.xyz文件,也可以直接通过AMSinput → File → Import Coordinates导入。
行 49: 行 49:
  
 =====三、提取密度-温度性质===== =====三、提取密度-温度性质=====
-为了从轨迹中提取密度和温度进行后处理,我们使用{{:adf:densities.rar|Python脚本densities.py}}。将其与*.ams输入文件放在同一文件夹中。+为了从轨迹中提取密度和温度进行后处理,我们使用Python脚本{{:adf:densities.rar|densities.py}}。将其与*.ams输入文件放在同一文件夹中。
  
 作业运行完毕后,运行该Python脚本提取密度-温度数据: 作业运行完毕后,运行该Python脚本提取密度-温度数据:
行 77: 行 77:
 {{ :adf:glasstmp09.png?750 }} {{ :adf:glasstmp09.png?750 }}
  
-应选择线性拟合的子集,以便获得最大值。如果r2值太低(即数据太嘈杂),或曲线不相交,我们建议尝试以下故障排除方法之一:+应选择适合线性拟合的子集,以便获得最大值(r^2)。如果r^2值太低(即数据太嘈杂),或曲线不相交,我们建议尝试以下故障排除方法之一:
   * 运行另一个模拟退火模拟   * 运行另一个模拟退火模拟
   * 扩大温度范围   * 扩大温度范围
adf/glasstmp.1636429846.txt.gz · 最后更改: 2021/11/09 11:50 由 liu.jun

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