adf:followcertainatoms

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--- adf:followcertainatoms [2023/06/21 16:31] – liu.jun
+++ adf:followcertainatoms [2024/03/03 21:25] (当前版本) – liu.jun
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 ======在Movie窗口如何快捷、方便的追踪特定原子群体？======
-首先我们需要知道我们关心的原子群体的编号，一般在建模的时候，可以检查一下，例如：
+=====一、在Movie中通过颜色直接标记少数原子====
+首先我们需要知道我们关心的少数几个原子的编号，一般在建模的时候，可以检查一下，例如：
 {{ :adf:followcertainatoms01.png?650 |}}
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 这样在Movie中就可以比较方面的追踪了。
+=====二、在Movie中通过颜色直接标记某类分子中的特定元素====
+Movie中，某一帧里面，例如我们细微标记CH4中的C元素，以及CH3中的C元素。
+Movie → MD Properties → Molecules，在关心的当前帧，点击右上角Show按钮，确保所有原子都不显示，然后单独只勾选CH4，这样就只显示CH4：
+{{ :adf:trace001.png?650 }}
+然后选中其中一个CH4的C原子，然后菜单栏Select → Select Atoms of Same Type，然后菜单栏View → Details：
+{{ :adf:trace002.png?650 }}
+点击如上图所示，其中一个被选中的C原子的颜色，例如改为蓝色，然后右键点击该蓝色框，将弹出提示：
+{{ :adf:trace003.png?250 }}
+点击Yes：
+{{ :adf:trace004.png?650 }}
+则所有C原子都改成了蓝色。
+类似，只显示所有CH3，然后修改即可。
+修改完毕后，重新点击分子列表中右上角的Show，使得所有分子都恢复显示。
+=====三、在Movie中通过颜色直接标记某种元素====
+Movie中选中这种元素的一个原子，然后菜单栏Select → Select Atoms of Same Type，则所有该元素原子都被选中。然后菜单栏View → Details，修改其中一个原子的颜色，例如改为蓝色，然后右键点击蓝色，弹窗点击Yes，则所有被选中的原子都改成了蓝色。
+=====四、从AMSinput中标记特定原子种群，便于在Movie中追踪去向=====
 另外也可以通过为某一类分子设置region，在Movie中也可以对这类分子特别显示，参考：[[adf:showatomsregion]]

adf/followcertainatoms.1687336304.txt.gz · 最后更改: 2023/06/21 16:31 由 liu.jun

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