甲基汞中毒机理的第一性原理研究

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甲基汞是一种亲电毒物,被世界卫生组织列为十大主要公共卫生关注物质之一。与生物相关硫醇和硒醇结合、破坏它们的功能,被认为是其毒性的分子基础。然而原子级别的实验研究,例如通过X射线结晶学,相当难以开展。来自Università degli Studi di Padova (意大利) 和 Universidade Federal de Santa Maria (巴西)的学者们,利用AMS的相对论密度泛函理论方法,通过三个步骤研究了甲基汞化学,模拟了甲基汞与硫蛋白和硒蛋白的相互作用和反应性。 1) 使用配体交换反应来模拟结合步骤(图1a),其中目标硒酸盐攻击金属中心,导致载体硫醇盐的置换。能量分解分析(EDA)表明配体交换基本上是分散的SN2@Hg 反应。 2) 通过溶剂辅助质子交换模型研究了甲基汞结合后,硫核还原过氧化物的能力,从而理解甲基汞硫还原过氧化物的速率介于完全质子化和完全去质子化硫之间,产生相应的硫氧化物(图1b和1c)。 3) 最后,研究了金属成键促进硒碳键断裂的机理假设,发现金属将电荷移向硒氧化物的氧的能力,促进了β-消除反应伴随硒碳键断裂,从而导致靶硒蛋白的不可逆抑制(图1d)。 这幅图描绘了毒素从环境(右下)到生物目标(左上)的移动过程,生物目标为一个中毒(黄色)的大脑。 a) 亚硒酸甲汞络合物与硫醇盐的配体交换反应的反应物络合物、过渡态和产物络合物; b) 过氧化氢辅助少量水分子氧化半胱氨酸甲基汞络合物; c) 甲基汞配合物的HOMO和过氧化氢的LUMO,主要参与氧化过程; d) MeHgSec和甲基硒代半胱氨酸(MeSec)的分子静电势图显示,甲基汞结合后,硒功能的氧原子上有较大的负电荷积累。 参考文献: Madabeni, A., Dalla Tiezza, M., Omage, F. B., Nogara, P. A., Bortoli, M., Rocha, J. B. T., and Orian, L. Chalcogen-Mercury Bond Formation and Disruption […]

铁中大角度晶界原子间键的强度(Adv. Mat. 2020)

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俄罗斯科学院南方科学中心Yuri F. Migal教授对铁中大角度晶界,杂质原子和合金元素原子的结合能进行了量子化学定量计算。 第四周期的元素,从钾到氪作为杂质。作者使用材料化学软件包AMS中BAND模块计算了晶体原始的能量(以孤立原子能量为参考点),以及分裂后两个体系各自的能量(以孤立原子能量为参考点),从而得到晶粒间结合能。用高角度边界模型计算的不同原子结构的结合能,与早期使用平面模型计算得到的结果定性上是一致的。结果表明,晶粒间的结合强度主要取决于晶界处原子的类型,原子的排列细节影响较小。 基于这样的现象,根据这些元素与铁之间的化学键的强弱,对位于晶界的元素进行分类成为可能。所有元素可分为三类:(i)加固作用;(ii)软化作用和(iii)不显著影响边界强度。第四周期元素,可以被分配第一类中,如钛、钒、铬、锰,钴和镍。包括硫酸钾的软化元素则包括钾、钙、砷、钪、硒、溴。这与已知的有关这些元素在实验方面的信息是一致的。  参考文献: Yuri F. Migal, Strength of Interatomic Bonds at High-Angle Grain Boundaries in Iron, Advanced Materials pp 227-234

 
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