概述
Advanced Workflows & Tools包含很多流程化研究的高级工具，包括对反应分子动力学轨迹中的基元反应进行分析的ChemTrayzer2.0，以及拟合DFTB参数与ReaxFF力场的ParAMS工具，微观动力学、OLED脚本工具与数据库、人工智能探索表面吸附、表面化学反应机理，以及根据反应物结构自动探索反应网络的工具ACE Reaction。
ChemTraYzer 2.0：分析分子动力学中的各类体系基元反应分析
功能简介
- 适用范围：不仅适用于小分子体系，大分子乃至聚合物、固体表面等，均能正确分析，而且大分子内部断键、成键也能检测到
- 支持用户自由指定时间范围进行分析，超大轨迹文件的分析处理更加灵活
- 分析控制参数更加灵活有效
- 以SMILES格式列出反应方程式、反应的级数
- 支持用户导出反应方程式列表的*.csv表格文件
结果分析
- 反应速率常数（统计平均值，最大值，最小值），单位为cm3/(mol∗s)、cm2/(mol2∗s)等，与实验单位一致，不需要用户复杂换算产物的占比、描述一个物种表现得像反应物或产物的程度的Mann-Kendall值
- 单独显示某个基元反应相关原子反应过程动画
- 相关反应次数、键变化次数柱状图
- 用户指定基元反应相关的几种分子的数量变化曲线
详细介绍：https://www.fermitech.com.cn/ams/reaxff2022-chemtrayzer-2/
Microkinetics：微观动力学模拟
在从试剂到最终产品的转化过程中，通常涉及许多较小的中间步骤。这些基本反应步骤具有各自不同的能垒和反应速率常数，它们的整合决定了整个系统的反应行为。通过微观动力学建模，对这样的系统进行研究，可以得到整体反应速率，以及限制整体反应速率的关键因素。包含如下功能：
- 计算温度范围内的反应速率
- 计算不同产物的选择性
- 确定反应的反应级数和表观活化能
- 计算所有反应步骤的速率控制程度
- 处理均相和异相反应
- 应用充分混合或活塞流反应器
- 模拟程序升温脱附
- 模拟同位素开关
ParAMS：DFTB参数、ReaxFF力场拟合优化工具
ParAMS是用于DFTB参数拟合、ReaxFF力场优化的一个集成化的成熟的图形化操作工具，是一个包括如下功能：
- 将AMS中的计算结果添加到训练集中
- 设定训练集每个样本的权重因子
- 导入样本力场、设定需要优化的参数
- 使用CMA-ES优化力场
- 交叉验证生成力场
注意，拟合DFTB或ReaxFF参数时，一般需要搭配ADF模块生成训练集。
其他
- ACE Reaction：根据反应物分子结构，预测出反应网络
- ReactMap：确定化学反应中反应物和产物之间的最佳原子映射
- OLED模拟工具：OLED器件的多尺度建模、气相沉积、计算薄膜中所有分子的电离势、电子亲和力和偶极矩等特性的分布、将数据传输到 Simbeyond 的Bumblebee代码，用于涉及您的材料的 OLED 设备模拟
- OLED工作流
- 人工智能PES Explorer：调用DFT、DFTB、MOPAC、ReaxFF、机器学习势，自动探索表面吸附位点、表面化学反应机理。