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atk:atk的硬件需求

QuantumATK的硬件需求

概述

  • 原则上,QuantumATK可以运行于绝大多数配置较新的计算机上,操作系统可以是Windows、Linux、MacOS系统上;
  • QuantumATK可以运行于笔记本电脑上,但对复杂体系进行计算和显示可能消耗很大的计算和图形显示资源;
  • 理想的运行计算的平台可以是集群或性能好的工作站。建议使用较新的64位处理器并且在Linux系统下并行运行64位版本的QuantumATK。计算通常并不需要很多节点,在3-4个节点上并行即可获得明显的速度提升。QuantumATK还可以充分利用多核计算。
  • 小体系(通常100原子以下)可以在笔记本电脑上运行,并且可以并行提速。并行计算可以运行在Linux和Windows系统上,但在Mac上不能并行。
  • VNL的图形界面应该运行在有硬件加速的显卡的计算机上。通常nVIDIA、ATI显卡的3D图形性能更好,Intel HD系列的的集成显卡也可以,但应该正确安装厂商提供的显卡驱动,例如Linux下不要使用Mesa等开源驱动。
  • QuantumATK的平台适应能力很强,在安装时很少遇到奇怪的问题。

CPU

QuantumATK可以运行在以下两种平台上:

  • i686:符合IA32架构的处理器,支持MMX和SSE指令集,包括有以下几种32位和64位的处理器
    • Intel:Pentium III, Pentium 4, Pentium M, Pentium D, Celeron M, Xeon, Pentium 4 EM64T, Xeon EM64T, Core Solo/Duo, Core 2 Solo/Duo/Quad/Extreme,等;
    • AMD: Athlon XP, Athlon MP, Athlon 64, Athlon 64 X2, Opteron, Duron, Sempron, Turion, 等。
  • 86_64:64位处理器,主要指EM64T和AMD64类型,例如:
    • Intel:Pentium 4 EM64T, Xeon EM64T, Pentium D, Core 2 Solo/Due/Quad/Extreme, 等;
    • AMD:Operon,Athlon 64,Turion 64,等。
  • 推荐使用64位的系统,从2017开始,QuantumATK将不再支持32位系统。

内存

QuantumATK计算对内存的需求依赖于要计算的体系和计算参数的选择。运行QuantumATK官网提供的教程实例,最少需要2GB的物理内存;运行大多数计算(最多大于500个原子)大约需要4GB内存。需要注意的是,某些参数选择可能会显著增加内存需求。

硬盘空间

QuantumATK在计算过程中会使用临时文件,计算结果的保存也需要硬盘空间。推荐至少 2GB 以上可用空间用于安装软件,保存数据则根据计算作业量多少变化。

图形显示

QuantumATK的图形界面VNL支持高级3D图形显示,为了获得更加的显示效果和操作体验,除了采用较高级的计算机处理器和内存外,建议采用高级的图形卡。推荐使用带有3D硬件加速的显卡,并安装显卡生产商提供的最新的驱动程序。

VNL需要OpenGL和Shader technology来快速渲染原子和电子结构。

  • 最低的OpenGL版本为1.2。此时无法使用shader高级的渲染功能,但可以运行最低的VNL图形界面。
  • 最低的shader库版本为3.3。目前,Mesa驱动无法支持shader,因此需要正确安装显卡厂商的驱动。

网络

运行QuantumATK软件需要启用最少一个网卡(不需联网),以便绑定license。

并行环境

操作系统相关

所有较新版本的操作系统(Windows、Linux、MacOS)都可以运行QuantumATK,推荐使用较新版本的Linux系统用于计算。

Linux系统相关

推荐使用长期维护(LTS)的Linux发行版。

注意:CentOS/RedHat 需要6.0版本以上才能正常运行QuantumATK。

Linux系统库关联

  • LIBC版本
    • glibc 2.7
    • libstdc++ 6.0.11 (GCC 4.4.0)
  • QuantumATK动态链接到以下库:
    • libatk-1.0.so.0
    • libcairo.so.2
    • libcrypt.so.1
    • libc.so.6
    • libdb-4.7.so
    • libdl.so.2
    • libfontconfig.so.1
    • libfreetype.so.6
    • libgcc_s.so.1
    • libgdbm.so.2
    • libgdk_pixbuf-2.0.so.0
    • libgdk-x11-2.0.so.0
    • libgio-2.0.so.0
    • libglib-2.0.so.0
    • libGL.so.1
    • libGLU.so.1
    • libgmodule-2.0.so.0
    • libgobject-2.0.so.0
    • libgthread-2.0.so.0
    • libgtk-x11-2.0.so.0
    • libICE.so.6
    • libjpeg.so.62
    • libm.so.6
    • libncurses.so.5
    • libncursesw.so.5
    • libnsl.so.1
    • libpanelw.so.5
    • libpango-1.0.so.0
    • libpangocairo-1.0.so.0
    • libpangoft2-1.0.so.0
    • libpng12.so.0
    • libpthread.so.0
    • librt.so.1
    • libSM.so.6
    • libstdc++.so.6
    • libutil.so.1
    • libX11.so.6
    • libX11-xcb.so.1
    • libxcb.so.1
    • libXext.so.6
    • libXft.so.2
    • libXi.so.6
    • libXmu.so.6
    • libXrender.so.1
    • libz.so.1
  • 以上库应当在Linux的软件仓库中找到,但可能未默认安装 (例如libxcb/libjpeg).
atk/atk的硬件需求.txt · 最后更改: 2018/03/20 18:13 由 liu.jun

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