atk:安装配置mpi并行环境
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| atk:安装配置mpi并行环境 [2017/03/22 15:38] – [在Windows系统上安装MPICH] dong.dong | atk:安装配置mpi并行环境 [2018/05/16 16:04] (当前版本) – [安装要求] fermi | ||
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| ====== 安装配置MPI并行环境 ====== | ====== 安装配置MPI并行环境 ====== | ||
| - | 本文介绍为在笔记本、台式单机和集群服务器上进行ATK MPI并行计算必须安装配置的MPI并行环境。 | + | 本文介绍为在笔记本、台式单机和集群服务器上进行QuantumATK |
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| + | <WRAP left important 70%> | ||
| + | ===重要提示=== | ||
| + | 从2017版开始，QuantumATK集成了Intel MPI运行环境，更好的分配MPI和OpenMP并行，推荐用户使用；不再需要参考此文安装MPI。 | ||
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| ===== 硬件需求 ===== | ===== 硬件需求 ===== | ||
| - | ATK可以在常见架构的多核工作站、笔记本电脑和集群上进行并行计算，不同的硬件、不同的并行度都会让计算效率得到不同的提升。 | + | QuantumATK可以在常见架构的多核工作站、笔记本电脑和集群上进行并行计算，不同的硬件、不同的并行度都会让计算效率得到不同的提升。 |
| 推荐的最佳并行方案是在多个多核节点上进行并行计算，不同计算类型（ATK-DFT、ATK-SE、ATK-Classical、ATK-FHIaims）可选择不同的并行策略。 | 推荐的最佳并行方案是在多个多核节点上进行并行计算，不同计算类型（ATK-DFT、ATK-SE、ATK-Classical、ATK-FHIaims）可选择不同的并行策略。 | ||
| - | <WRAP center tip 80%> | + | <WRAP center tip> |
| 进行MPI并行计算需要软件license中有Slave支持。用户需要购买并行所需的Slave数。 | 进行MPI并行计算需要软件license中有Slave支持。用户需要购买并行所需的Slave数。 | ||
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| ===== 安装要求 ===== | ===== 安装要求 ===== | ||
| - | ATK的MPI并行计算需要用户自行安装[[http:// | + | QuantumATK的MPI并行计算需要用户自行安装[[http:// |
| - | ATK支持以下几种MPICH2的进程管理器： | + | QuantumATK支持以下几种MPICH2的进程管理器： |
| * mpd | * mpd | ||
| * gforker | * gforker | ||
| * hydra | * hydra | ||
| - | <WRAP center important | + | <WRAP center important> |
| ATK并行计算不支持OpenMPI。 | ATK并行计算不支持OpenMPI。 | ||
| </ | </ | ||
| 行 29: | 行 35: | ||
| 在Windows系统上，MPICH已经随安装包提供并安装。请进行以下操作以使用MPICH。 | 在Windows系统上，MPICH已经随安装包提供并安装。请进行以下操作以使用MPICH。 | ||
| - 使用管理员权限打开命令提示符窗口； | - 使用管理员权限打开命令提示符窗口； | ||
| - | - 进入ATK安装的文件夹，例如 C:\Program Files (x86)\QuantumWise\VNL-ATK-2016.3\bin\mpich； | + | - 进入QuantumATK安装的文件夹，例如 C:\Program Files (x86)\QuantumWise\VNL-ATK-2016.3\bin\mpich； |
| - 运行 命令 smpd.exe -install。输出以下信息：MPICH2 Process Manager, Argonne National Lab installed. | - 运行 命令 smpd.exe -install。输出以下信息：MPICH2 Process Manager, Argonne National Lab installed. | ||
| - 要验证MPICH是否成功安装，打开VNL图形界面，进行下面的操作； | - 要验证MPICH是否成功安装，打开VNL图形界面，进行下面的操作； | ||
| 行 89: | 行 95: | ||
| 输出结果为各节点的主机名。 | 输出结果为各节点的主机名。 | ||
| - | ===== ATK并行计算测试 ===== | + | ===== QuantumATK并行计算测试 ===== |
| - | 若以上安装都正确无误，则可以进行ATK的并行测试。下载测试脚本test_mpi.py（ATK安装目录的examples/ | + | 若以上安装都正确无误，则可以进行QuantumATK的并行测试。下载测试脚本test_mpi.py（QuantumATK安装目录的examples/ |
| <file python test_mpi.py> | <file python test_mpi.py> | ||
| import platform, time, random | import platform, time, random | ||
atk/安装配置mpi并行环境.1490168282.txt.gz · 最后更改: 2017/03/22 15:38 由 dong.dong