差别

这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。

--- atk:安装配置mpi并行环境 [2016/08/15 16:48] – [设置节点间SSH无密码通信] dong.dong
+++ atk:安装配置mpi并行环境 [2018/05/16 16:04] (当前版本) – [安装要求] fermi
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 ====== 安装配置MPI并行环境 ======
-本文介绍为在笔记本、台式单机和集群服务器上进行ATK MPI并行计算必须安装配置的MPI并行环境。
+本文介绍为在笔记本、台式单机和集群服务器上进行QuantumATK MPI并行计算必须安装配置的MPI并行环境。
+<WRAP left important 70%>
+===重要提示===
+从2017版开始，QuantumATK集成了Intel MPI运行环境，更好的分配MPI和OpenMP并行，推荐用户使用；不再需要参考此文安装MPI。
+</WRAP>
 ===== 硬件需求 =====
-ATK可以在常见架构的多核工作站、笔记本电脑和集群上进行并行计算，不同的硬件、不同的并行度都会让计算效率得到不同的提升。
+QuantumATK可以在常见架构的多核工作站、笔记本电脑和集群上进行并行计算，不同的硬件、不同的并行度都会让计算效率得到不同的提升。
 推荐的最佳并行方案是在多个多核节点上进行并行计算，不同计算类型（ATK-DFT、ATK-SE、ATK-Classical、ATK-FHIaims）可选择不同的并行策略。
-<WRAP center tip 80%>
+<WRAP center tip>
 进行MPI并行计算需要软件license中有Slave支持。用户需要购买并行所需的Slave数。
 </WRAP>
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 ===== 安装要求 =====
-ATK的MPI并行计算需要用户自行安装[[http://www.mpich.org/|MPICH]]。在Linux系统上推荐安装最新版的MPICH 3.x；在Windows系统上，只能使用老版本的MPICH2 1.4.1p1。其他与与MPICH兼容的[[http://mvapich.cse.ohio-state.edu/news/|MVAPICH2]]和[[https://software.intel.com/en-us/intel-mpi-library|Intel MPI]]也能用。
+QuantumATK的MPI并行计算需要用户自行安装[[http://www.mpich.org/|MPICH]]。在Windows系统上，MPICH已经随安装包提供并安装。在Linux系统上推荐安装最新版的MPICH 3.x；其他与与MPICH兼容的[[http://mvapich.cse.ohio-state.edu/news/|MVAPICH2]]和[[https://software.intel.com/en-us/intel-mpi-library|Intel MPI]]也能用。
-ATK支持以下几种MPICH2的进程管理器：
+QuantumATK支持以下几种MPICH2的进程管理器：
   * mpd
   * gforker
   * hydra
-<WRAP center important 80%>
+<WRAP center important>
 ATK并行计算不支持OpenMPI。
 </WRAP>
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 ==== 在Windows系统上安装MPICH ====
-对于Windows系统，MPICH提供了二进制安装包，可以直接下载运行。请选择适合系统的32位或64位安装包。
-  * 第一步：在安装过程中选择为所有人（Everyone）安装MPICH；
+在Windows系统上，MPICH已经随安装包提供并安装。请进行以下操作以使用MPICH。
-  * 第二步：安装过程中使用默认的passphrase；
+  - 使用管理员权限打开命令提示符窗口；
-  * 第三步：安装成功后，请将mpiexec.exe和smpd.exe添加到防火墙例外（允许这两个程序）；
+  - 进入QuantumATK安装的文件夹，例如 C:\Program Files (x86)\QuantumWise\VNL-ATK-2016.3\bin\mpich；
-  * 第四步：将MPICH2的bin文件夹添加到环境变量''PATH''中；
+  - 运行 命令 smpd.exe -install。输出以下信息：MPICH2 Process Manager, Argonne National Lab installed.
-  * 第五步：右单击命令行图标选择''Run as administrator''(使用管理员运行)，逐条输入以下命令：
+  - 要验证MPICH是否成功安装，打开VNL图形界面，进行下面的操作；
-<code>
+  - 添加一个 new machine，选择作业类型 Multiprocess Parallel；设置默认的MPI进程数；
-smpd -install
+  - 设置 MPI 可执行文件的路径，例如：C:\Program Files (x86)\QuantumWise\VNL-ATK-2016.3\bin\mpich and select the mpiexec.exe；
-mpiexec -remove
+  - 使用新添加的machine尝试运行作业。
-mpiexec -register
-mpiexec -validate  (没有输出)
-smpd -status       (结果返回类似'smpd running on <hostname>'的信息)
-</code>
 ==== 在Linux系统上安装MPICH ====
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 输出结果为各节点的主机名。
-===== ATK并行计算测试 =====
+===== QuantumATK并行计算测试 =====
-若以上安装都正确无误，则可以进行ATK的并行测试。下载测试脚本test_mpi.py（ATK安装目录的examples/atkpython下也有类似的脚本）到主目录：
+若以上安装都正确无误，则可以进行QuantumATK的并行测试。下载测试脚本test_mpi.py（QuantumATK安装目录的examples/atkpython下也有类似的脚本）到主目录：
 <file python test_mpi.py>
 import platform, time, random

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