差别

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--- atk:声子振动模式分析 [2016/12/07 12:08] – [振动模式] dong.dong
+++ atk:声子振动模式分析 [2018/03/20 22:16] (当前版本) – liu.jun
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 <WRAP center info 100%>
-===注意===
+=== 提示 ===
+**本教程使用特定版本的QuantumATK创建，因此涉及的截图和脚本参数可能与您实际使用的版本略有区别，请在学习时务必注意。**
+</WRAP>
+<WRAP center info 100%>
+===提示===
 振动性质的计算需要构型中的动力学矩阵（**dynamical matrix**），它描述了原子脱离平衡位置时的力响应。
 </WRAP>
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 ==== 计算设置 ====
-打开**Builder**并进行以下操作：
+打开 **Builder** 并进行以下操作：
-  * 使用 Add ‣ From Database向stash添加 “Silicon (alpha)” 。
+  * 使用 Add ‣ From Database 向 stash 添加 “Silicon (alpha)” 。
-  * 使用Bulk Tools ‣ Supercell将原胞转换为超胞。
+  * 使用 Bulk Tools ‣ Supercell 将原胞转换为超胞。
 {{ :atk:conventional_cell.png?500 |}}
-  * 使用Bulk Tools ‣ Repeat将结构进行6*6*8的重复，产生含有2304个硅原子的构型。
+  * 使用 Bulk Tools ‣ Repeat 将结构进行 6*6*8 的重复，产生含有 2304 个硅原子的构型。
-  * 使用Selection Tools,通过在By Expression中的语句, 切出一个柱状结构。
+  * 使用 Selection Tools,通过在 By Expression 中的语句, 切出一个柱状结构。
-<WRAP center round info 100%>
+<WRAP center info 100%>
-**提示！**
+===提示===
-语句“z > 20 and x < 10”将会选择构型的某一部分，然后可以通过Edit ‣ Delete Atoms将这些部分删除。
+语句 “z > 20 and x < 10” 将会选择构型的某一部分，然后可以通过 Edit ‣ Delete Atoms 将这些部分删除。
 </WRAP>
-  * 普通列表项目增加柱子指向方向的晶格矢量以在有柱薄膜上下方产生真空区域。
+  * 增加柱子指向方向的晶格矢量以在有柱薄膜上下方产生真空区域。
 {{ :atk:builder_siliconpillared.png?500 |}}
-  * 将构型送到**Scripter**并添加一个**Calculator**,一个**PhononBandstructure** 分析对象和两个**VibrationalMode** 对象。
+  * 将构型送到 **Scripter** 并添加一个 **Calculator**, 一个 **PhononBandstructure** 分析对象和两个 **VibrationalMode** 对象。
-  * 将计算器设置为ATK-Classical。
+  * 将计算器设置为 ATK-Classical。
-<WRAP center round info 100%>
-**注意！**
+<WRAP center info 100%>
+===注意===
 当计算三维结构时，你可以保留**DynamicalMatrix**中的设置为默认值。
 </WRAP>
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 打开 **PhononBandstructure** 后
   * 设置 “Points pr. segment” 为100;
-  * 设置 “Number of bands” 为50;
+  * 设置 “Number of bands” 为 50;
   * 设置布里渊区路径为 [G, X].
 编辑两个 **VibrationalMode** 对象为计算在Γ点 (0, 0, 0) 和在 X点 (0.5, 0, 0)的振动模式，并在两个对象中选择模式数[0,1,2,3,4,5,6,7,8] 。
-运行计算。对于单CPU核将会花费一段时间，但是对于并行计算将会很快完成。
+运行计算。对于单 CPU 核将会花费一段时间，但是对于并行计算将会很快完成。
 ==== 结果 ====
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 ===== 参考文献 =====
-[DH14]	(1, 2) Bruce L. Davis and Mahmoud I. Hussein. Nanophononic metamaterial: Thermal conductivity reduction by local resonance. Phys. Rev. Lett., 112:055505, Feb 2014. doi:10.1103/PhysRevLett.112.055505.
+  * [DH14]	(1, 2) Bruce L. Davis and Mahmoud I. Hussein. Nanophononic metamaterial: Thermal conductivity reduction by local resonance. Phys. Rev. Lett., 112:055505, Feb 2014. doi:10.1103/PhysRevLett.112.055505.
+  * [GAZW+13]	Mahdi Ghorbani-Asl, Nourdine Zibouche, Mohammad Wahiduzzaman, Augusto F. Oliveira, Agnieszka Kuc, and Thomas Heine. Electromechanics in mos2 and ws2: nanotubes vs. monolayers. Scientific Reports, 2013. doi:10.1038/srep02961.
-[GAZW+13]	Mahdi Ghorbani-Asl, Nourdine Zibouche, Mohammad Wahiduzzaman, Augusto F. Oliveira, Agnieszka Kuc, and Thomas Heine. Electromechanics in mos2 and ws2: nanotubes vs. monolayers. Scientific Reports, 2013. doi:10.1038/srep02961.
+  * [JPR13]	Jin-Wu Jiang, Harold S. Park, and Timon Rabczuk. Molecular dynamics simulations of single-layer molybdenum
+  * disulphide (mos2): Stillinger-weber parametrization, mechanical properties, and thermal conductivity. Journal of Applied Physics, 114(6):–, 2013. doi:10.1063/1.4818414.
-[JPR13]	Jin-Wu Jiang, Harold S. Park, and Timon Rabczuk. Molecular dynamics simulations of single-layer molybdenum
+  * [JPR14]	(1, 2) Jin-Wu Jiang, Harold S. Park, and Timon Rabczuk. Mos2 nanoresonators: intrinsically better than graphene? Nanoscale, 6:3618–3625, 2014. doi:10.1039/C3NR05991J.
-disulphide (mos2): Stillinger-weber parametrization, mechanical properties, and thermal conductivity. Journal of Applied Physics, 114(6):–, 2013. doi:10.1063/1.4818414.
+  * [YSB+14]	Rusen Yan, Jeffrey R. Simpson, Simone Bertolazzi, Jacopo Brivio, Michael Watson, Xufei Wu, Andras Kis, Tengfei Luo, Angela R. Hight Walker, and Huili Grace Xing. Thermal conductivity of monolayer molybdenum disulfide obtained from temperature-dependent raman spectroscopy. ACS Nano, 8(1):986–993, 2014. doi:10.1021/nn405826k.
+  * 原文：http://docs.quantumwise.com/tutorials/vibrational_modes.html
-[JPR14]	(1, 2) Jin-Wu Jiang, Harold S. Park, and Timon Rabczuk. Mos2 nanoresonators: intrinsically better than graphene? Nanoscale, 6:3618–3625, 2014. doi:10.1039/C3NR05991J.
+  * 本文翻译：王吉章
-[YSB+14]	Rusen Yan, Jeffrey R. Simpson, Simone Bertolazzi, Jacopo Brivio, Michael Watson, Xufei Wu, Andras Kis, Tengfei Luo, Angela R. Hight Walker, and Huili Grace Xing. Thermal conductivity of monolayer molybdenum disulfide obtained from temperature-dependent raman spectroscopy. ACS Nano, 8(1):986–993, 2014. doi:10.1021/nn405826k.
-本文翻译：王吉章

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