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atk:使用vnl-gui构建结构模型

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atk:使用vnl-gui构建结构模型 [2016/11/03 10:47] – [导入其他结构文件] dong.dongatk:使用vnl-gui构建结构模型 [2018/03/20 18:31] (当前版本) liu.jun
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 **VNL Builder** 是VNL的全功能建模工具,内含结构数据库、结构操作工具、转换工具,以及多种的模板建模工具。 **VNL Builder** 是VNL的全功能建模工具,内含结构数据库、结构操作工具、转换工具,以及多种的模板建模工具。
-**VNL Builder** 还支持直接在线查询Crystallography Open Database (COD)中的几十万种晶体结构数据。 
  
  
  
-===== VNL-ATK支持的结构模型 =====+ 
 +===== QuantumATK支持的结构模型 =====
  
 在Builder中可以创建Bulk、Device、Molecule和NEB四种结构模型,他们分别支持: 在Builder中可以创建Bulk、Device、Molecule和NEB四种结构模型,他们分别支持:
 ^  模型名称      ^ 支持的体系                            ^ 边界条件    ^ 支持的计算工具           ^ ^  模型名称      ^ 支持的体系                            ^ 边界条件    ^ 支持的计算工具           ^
-|  Bulk      | 晶体结构素单胞、结晶学单胞、超胞、表面Slab、界面Slab等周期结构体系    | 周期边界条件  | 可用于ATK、VASP等进行计算 +|  Bulk      | 晶体结构素单胞、结晶学单胞、超胞、表面Slab、界面Slab等周期结构体系    | 周期边界条件  | 可用于QuantumATK、VASP等进行计算 
-|  Device    | 基于开放边界条件的双电极器件体系,模拟器件和材料的界面                 | 开放边界条件  | 仅用于ATK计算          | +|  Device    | 基于开放边界条件的双电极器件体系,模拟器件和材料的界面                 | 开放边界条件  | 仅用于QuantumATK计算          | 
-|  Molecule  | 非周期的孤立体系                         | 狄利克雷边界条件  | 仅用于ATK计算          | +|  Molecule  | 非周期的孤立体系                         | 狄利克雷边界条件  | 仅用于QuantumATK计算          | 
-|  Surface   | 单边半无限表面模型 (ATK独有模型)          | 开放边界条件+Neumann边界条件 | 仅用于ATK计算 | +|  Surface   | 单边半无限表面模型 (QuantumATK独有模型)          | 开放边界条件+Neumann边界条件 | 仅用于QuantumATK计算 | 
-|  NEB       | 用于NEB计算的初始路径,含有从初始结构到最终结构的一系列结构  | --      | 可用于ATK、VASP等进行计算  |+|  NEB       | 用于NEB计算的初始路径,含有从初始结构到最终结构的一系列结构  | --      | 可用于QuantumATK、VASP等进行计算  |
  
 通常计算模拟的基本模型是Bulk模型,这里的Bulk是广义的三维周期结构模型(相对于Device和Molecule模型而言),这包括所有带有三维周期边界条件的体系,例如带有真空填充层的表面Slab模型。 通常计算模拟的基本模型是Bulk模型,这里的Bulk是广义的三维周期结构模型(相对于Device和Molecule模型而言),这包括所有带有三维周期边界条件的体系,例如带有真空填充层的表面Slab模型。
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 ==== 导入其他结构文件 ==== ==== 导入其他结构文件 ====
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-=== 支持的文件格式 === 
  
 VNL Builder支持导入几乎可以导入所有常见类型的结构文件。例如:包括:XYZ(*.xyz)、CAR(*.car)、CASTEP(*.cell、*.geom)、CIF(*.cif)、FHI-aims(*.in)、Quantum Espresso(*.in)、ASE(*.py)、VASP(POSCAR、CONTCAR)等。 VNL Builder支持导入几乎可以导入所有常见类型的结构文件。例如:包括:XYZ(*.xyz)、CAR(*.car)、CASTEP(*.cell、*.geom)、CIF(*.cif)、FHI-aims(*.in)、Quantum Espresso(*.in)、ASE(*.py)、VASP(POSCAR、CONTCAR)等。
  
- +==== 在线检索结构数据库 ==== 
 +**VNL Builder** 还支持直接在线查询Crystallography Open Database (COD)中的几十万种晶体结构数据,详见:[[atk:vnl的结构数据库功能|]]。
  
  
atk/使用vnl-gui构建结构模型.1478141256.txt.gz · 最后更改: 2016/11/03 10:47 由 dong.dong

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