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atk:quantumatk-se中的dftb模型

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QuantumATK-SE中的DFTB模型

本教程的目的是向您展示如何在 ATK-SE 中实现在基于密度泛函的紧束缚(DFTB)模型[1][2]中安装新参数集。

ATK 附带了 CP2K 和 Hotbit 合作的 Slater-Koster 参数文件,用于半经验 DFTB 模型。本教程将介绍如何从 DFTB 网站下载其他参数并安装,使它们作为 ATK 的本机部分工作。

安装参数以后,它们就可以用于构建分子、块体和器件系统。在本教程中,您将首先下载并安装 DFTB 参数集,然后学习如何使用 Slater-Koster 计算器计算自旋极化块体系统的性质。

注意

您将主要使用图形用户界面的 QuantumATK 进行设置和分析结果。如果您不熟悉 QuantumATK,我们建议您先阅读一些 QuantumATK 教程

本教程的基础计算引擎是 ATK-SE,为 QuantumATK 的半经验部分。有关所有参数的完整说明,以及在许多情况下对其物理相关性的详细讨论,请参见 ATK Reference Manual

为运行本教程并采用 ATK 中通常使用的半经验模型,您必须拥有 ATK-SE 的许可。如果您没有,可以通过网站联系我们获取限时的演示许可:Contact QuantumWise

安装 DFTB 参数

获取 DFTB 的许可

dftb.org 网站上有许多 DFTB 方法中可以与 ATK-SE 一起使用的参数。为下载参数,您需要填写他们的注册表。完成注册后,您将收到网站的用户名和密码。

下载参数

在 DFTB 的下载页面上,您可以看到不同 DFTB 参数集的概述。主要部分是名称为“mio”、“pbc”和“matsci”的参数集,“mio”集可以通过下面进一步列出的大量专业集进一步扩展。该页面还列出了使用参数集时必须参考的论文。

登录 dftb.org 并下载您感兴趣的参数集。下载的文件将位于压缩的 tar 文件(.tar.gz)中。

安装参数

ATK 为三个 DFTB 参数集中的每一个都设立了一个特殊的文件夹。例如,安装“mio”参数集势,请解压缩下载的 tar 文件并将 .skf 文件复制到安装 ATK 的目录下 share / tightbinding / dftb / mio / 。在 Linux 中,您可以使用以下命令:

tar zxvf mio-1-1.tar.gz
cp mio-1-1/* [ATKPATH]/share/tightbinding/dftb/mio

其中 [ATKPATH] 是安装 QuantumATK 的路径。同样地,应将“pbc”和“matsci”参数文件分别复制到 dftb / pbcdftb / matsci 目录中。请注意,这些目录都是已经存在的,但是空的。

警告

如果您在笔记本电脑或工作站上使用 QuantumATK 设置计算,然后在集群上单独安装 ATK 运行计算,则必须分别在两个系统上都安装参数文件。

测试安装

能带结构计算

用 DFTB 计算自旋极化

计算石墨烯带的自旋极化

使用脚本计算一系列构型的性质

参考

atk/quantumatk-se中的dftb模型.1558882569.txt.gz · 最后更改: 2019/05/26 22:56 由 xie.congwei

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