adf:onlyatomscompleted
差别
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| 后一修订版 | 前一修订版 | ||
| adf:onlyatomscompleted [2016/12/29 15:15] – 创建 liu.jun | adf:onlyatomscompleted [2020/10/17 19:06] (当前版本) – [问题检测] liu.jun | ||
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| 行 1: | 行 1: | ||
| ====== 故障：只完成原子计算，不进行分子计算 ====== | ====== 故障：只完成原子计算，不进行分子计算 ====== | ||
| + | =====前言===== | ||
| + | ADF的计算过程是：首先用Slater基组计算原子，得到原子的轨道，用原子的轨道作为基组，计算整个分子。因此在logfile里面，可以看到，先完成原子的计算，然后列出分子的坐标，然后计算整个分子。具体如下： | ||
| =====问题检测===== | =====问题检测===== | ||
| 行 18: | 行 20: | ||
| 原子，内容与上面类似。 | 原子，内容与上面类似。 | ||
| - | 原子计算结束后，开始计算整个分子。正常的情况应该是出现类似如下信息： | + | 原子计算结束后，开始计算整个分子。正常的情况应该是出现类似如下信息（本例是进行结构优化）： |
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| 行 30: | 行 32: | ||
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| - | 这就开始了分子的计算。 | + | 这里列出了要计算的整个分子的坐标，之后开始了分子的计算。 |
| - | 但如果这部分内容一直不能开始，在命令行也检查不到adf.exe的进程，那么这很可能是由于无密码通讯设置不完善造成。 | + | 但如果这部分内容一直不能开始，也检查不到adf.exe的进程，那么这很可能是由于无密码通讯设置不完善造成。 |
| + | |||
| + | **对于Linux：** | ||
| 一般在集群或单个服务器（联网或不联网都是如此），在节点间切换，例如从node01节点切换到node02节点，可以在node01的命令行输入ssh node02回车。然后就会登陆到node02节点，正常情况下，是不需要输入密码的，系统管理员一般而言，已经完成了免密码登录的配置；如果是单个服务器，例如ip是192.168.1.100，那么自己切换到自己，应该是不需要输入密码的——即如果当前在192.168.1.100服务器上，在命令行执行ssh 192.168.1.100回车，之后是不需要输入密码的。 | 一般在集群或单个服务器（联网或不联网都是如此），在节点间切换，例如从node01节点切换到node02节点，可以在node01的命令行输入ssh node02回车。然后就会登陆到node02节点，正常情况下，是不需要输入密码的，系统管理员一般而言，已经完成了免密码登录的配置；如果是单个服务器，例如ip是192.168.1.100，那么自己切换到自己，应该是不需要输入密码的——即如果当前在192.168.1.100服务器上，在命令行执行ssh 192.168.1.100回车，之后是不需要输入密码的。 | ||
| 行 38: | 行 42: | ||
| 倘若这种设置没有完善，在节点切换时，需要输入密码，那么就会导致计算不能进行（能够完成原子计算部分，而分子计算部分则一直不开始，也不结束，无论等多久都没有任何反应）。 | 倘若这种设置没有完善，在节点切换时，需要输入密码，那么就会导致计算不能进行（能够完成原子计算部分，而分子计算部分则一直不开始，也不结束，无论等多久都没有任何反应）。 | ||
| + | **对于Windows：** | ||
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| + | 往往是杀毒软件把ADF并行计算禁止了，这在安装过程中，防火墙会弹出提示，如果不理会，则会自动禁止。WSASocket failed, error 10060报错，就是由于防火墙引起的，关闭防火墙就正常工作了。或者把AMS进程加入到白名单。 | ||
| =====解决方式(Linux系统)===== | =====解决方式(Linux系统)===== | ||
adf/onlyatomscompleted.1482995713.txt.gz · 最后更改: 2016/12/29 15:15 由 liu.jun