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药物[目录]

AMS开发组COSMO-RS/COSMO-SAC中文讲座视频:溶剂筛选、共晶预测、离子液体

2022年11月5日,AMS(Amsterdam Modeling Suite)开发者荷兰SCM公司与费米科技,结合广大老师、同学们前期对讲座内容需求的反馈,联合举办COSMO-RS和COSMO-SAC在线讲座。SCM公司陈威霖博士介绍了有关COSMO-RS的理论以及计算溶液热力学性质的现实溶剂法和分段活度系数法,并展示在AMS的图形窗口中如何进行简单计算,以及使用python脚本展示更强大的应用案例,包括:溶解度筛选、共晶筛选、共熔溶剂、离子液体。

讲座内容如下:

  • 脚本下载(其中example3_Hex.py已经改进,支持输入任意数量的异构体)
  • 第一部分:
  • 第二部分:(视频链接
    • PLAMS环境下使用Python脚本进行COSMO-RS计算
    • 应用1:溶解度
    • 使用Python脚本进行溶剂筛选
  • 第三部分:(视频链接
    • 应用2:药物共晶
    • 使用图形窗口/Python脚本进行过剩焓的计算
    • 应用3:共晶溶剂
    • 使用Python脚本进行共晶点计算
    • 共晶溶剂筛选
  • 第四部分:(视频链接
    • 应用4:离子液体
    • 离子液体的亨利常数计算
    • 基于亨利常数的离子液体筛选

未来我们计划继续开展类似讲座,因此长期面向广大师生征集讲座课题,敬请提供感兴趣内容建议,我们将在开课时通过邮件通知您参与信息。

补充材料

过剩焓的计算脚本,后续进行了升级,增加了“允许输入多种溶质、多种溶质、溶剂比例”的功能,下载链接

使用方法,修改如下:

多种溶质、异构体的输入(每种溶质的多个异构体占一行,#后的内容为注释,可以删除)

solute_list=[
            ["CBZ_1.coskf","CBZ_2.coskf"],  #carbamazepine
            ["itz_c1.coskf"]                		#itraconazole
          ]

溶剂的输入与溶质类似,与以前相同:

solv_list=[
           ["tartaric_acid_c1.coskf","tartaric_acid_c2.coskf","tartaric_acid_c3.coskf"], 
           ["PABA_1.coskf"] 				#p-Aminobenzoic acid
        ]

溶质与溶剂的占比,例如下面的1:3,1:2,1:1,2:1,3:1

solute_ratio =[1,1,1,2,3]
solvent_ratio=[3,2,1,1,1]

不同占比的实际效果,需要用户在应用的过程中,也进行实际探索,验证其有效性。

adf/drugs.1682237645.txt.gz · 最后更改: 2023/04/23 16:14 由 liu.jun

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