分子动力学计算扩散系数，结果与分子动力学该次模拟分子运动轨迹相关。以甲醇、乙醇、1-丙醇为例，计算扩散系数。298K标准大气压下，三者扩散系数实验数据分别为：1.54x$10^{-9}m^2/s$、1.22x$10^{-9}m^2/s$、1.05x$10^{-9}m^2/s$

扩散系数计算所依据的理论，参考：Journal of Chemical Information and Modeling 2011 51 (8), 2007-2023