adf:dftmd-band
差别
这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
| adf:dftmd-band [2020/12/19 16:05] – liu.jun | adf:dftmd-band [2024/05/09 08:33] (当前版本) – liu.jun | ||
|---|---|---|---|
| 行 1: | 行 1: | ||
| - | ======如何进行基于DFT的周期性边界分子动力学模拟====== | + | ======AIMD教程====== |
| ADF2016.102版增加了基于DFT的分子动力学模拟功能。ADF模块、BAND模块、DFTB模块等包含这个功能（目前正在不断完善中，有兴趣的用户可以尝试使用）： | ADF2016.102版增加了基于DFT的分子动力学模拟功能。ADF模块、BAND模块、DFTB模块等包含这个功能（目前正在不断完善中，有兴趣的用户可以尝试使用）： | ||
| 行 19: | 行 19: | ||
| MD模拟，一般容易出现远离平衡结构的一些构型，从而导致SCF难以收敛，因此需要降低收敛条件： | MD模拟，一般容易出现远离平衡结构的一些构型，从而导致SCF难以收敛，因此需要降低收敛条件： | ||
| - | {{ : | + | {{ : |
| - | 这里设置了电子温度为0.2eV，因此电子能级出现偶然简并的情况，也能够正确收敛。注意电子温度与实际温度，在定义上导致了二者没有直接关系。 | + | 这里设置了电子温度为0.2eV，因此电子能级出现偶然简并的情况，也能够正确收敛。注意电子温度与实际温度，在定义上导致了二者没有直接关系。Criterion是SCF收敛标准，虽然这个值会自动根据Numerical Quality以及体系的大小自动调整，但我们还是可以人为的增大这个值，降低收敛的标准，例如0.00005，体系越大，这个值也可以设置的越大。这两个值设置的越大，SCF收敛越快，MD也就越快，也会降低精度。 |
| Model > MD设置分子动力学参数，Number of steps是模拟的步数，步长一般0.25fs是比较合适的，所以这个例子里面模拟了2.5ps。Sample Frequency：10是指每10步保存一次原子运动轨迹。 | Model > MD设置分子动力学参数，Number of steps是模拟的步数，步长一般0.25fs是比较合适的，所以这个例子里面模拟了2.5ps。Sample Frequency：10是指每10步保存一次原子运动轨迹。 | ||
| 行 39: | 行 39: | ||
| 保存run文件并直接运行任务，参考：[[adf: | 保存run文件并直接运行任务，参考：[[adf: | ||
| - | 结果查看： | + | ====基元反应分析==== |
| - | 轨迹保存在*results/ | + | 轨迹保存在*results/ |
| + | |||
| + | 如果使用AMS2024及其以上版本，在Movie → MD Properties → ChemTraYzer2中，可以分析MD过程中产生的基元反应数量、种类、反应速率常数，并分析各种物质作为反应物、产物的真实性。具体参考：https:// | ||
adf/dftmd-band.1608365136.txt.gz · 最后更改: 2020/12/19 16:05 由 liu.jun