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adf:collapse [2017/03/06 17:58] – liu.jun | adf:collapse [2021/05/25 14:26] (当前版本) – [3,运行任务] liu.jun | ||
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行 1: | 行 1: | ||
======如何模拟撞击====== | ======如何模拟撞击====== | ||
+ | 注意,本教程是针对版本低于2019的软件。对2019版以上,可以参考:[[adf: | ||
- | 本例以两个铁片层的撞击。事实上,模拟团簇对表面的撞击,设置方式也是一摸一样的。[[https:// | + | ======模型====== |
- | ======1,建模====== | + | 本例以两个铁片层的撞击。事实上,模拟团簇对表面的撞击,设置方式也是一摸一样的。 |
- | 在[[http:// | + | 我们以两层铁原子为例,点击View > Axes显示坐标系(选中原子edit - set origin设置原点,选中两个原子edit - align - With X-axes设置x轴方向),并设置一般的分子动力学参数: |
- | + | ||
- | [[http:// | + | |
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- | ADFinput > File > Import Coordinates: | + | |
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- | 之后点击右下角的四个圆点图标,将默认的3*3*3周期显示切换成只显示一个周期: | + | |
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- | {{ : | + | |
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- | 创建5*5*5的超包: | + | |
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- | {{ : | + | |
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- | {{ : | + | |
- | + | ||
- | 切换到ReaxFF模块: | + | |
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- | 点击View > Axises显示坐标系: | + | |
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- | 之后删掉中间的原子层,保留两层(垂直于Z轴),并将Cell的C方向拉长到54.25埃: | ||
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- | 并设置模拟参数如下: | ||
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- | 详细的模拟参数,参考:[[adf: | ||
=====2,设置撞击参数===== | =====2,设置撞击参数===== | ||
行 206: | 行 180: | ||
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- | 这段内容,对数字的格式要求非常严格,也就是数字的位数,必须和上述一致。上述四组数字,分别描述ADFinput中50个原子的坐标、速度、加速度、温度。 | + | 这段内容,对数字的格式要求非常严格,也就是数字的位数,必须和上述一致。上述四组数字,分别描述ADFinput中50个原子的<color blue> |
如果运行出现问题,最好参考本例*.run文件,在上面进行修改。 | 如果运行出现问题,最好参考本例*.run文件,在上面进行修改。 | ||
行 214: | 行 188: | ||
在ADFjobs窗口,选中该任务,之后点击Job > Run提交任务。 | 在ADFjobs窗口,选中该任务,之后点击Job > Run提交任务。 | ||
- | 在SCM Logo > Movie,查看GCMC模拟的动画过程。动画观看(点击) | + | 在SCM Logo > Movie,查看动画过程。上述设置的速度相反、加速度也相反,因此必然会撞击在一起: |
- | + | ||
- | 上述设置的速度相反、加速度也相反,因此必然会撞击在一起: | + | |
第1帧: | 第1帧: | ||
行 230: | 行 202: | ||
{{ : | {{ : | ||
- | 撞击: | + | 撞在一起后,互相速度抵消,在该位置进行平衡的热振动,并发生不规则的形变。 |
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- | 撞在一起后,互相速度抵消,在该位置进行平衡的热振动,并发生不规则的形变。 | ||
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