差别

这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。

--- adf:1d-peda [2019/12/09 18:42] – [模型] liu.jun
+++ adf:1d-peda [2020/11/30 16:33] (当前版本) – [如何进行一维周期性体系的结合能、能量分解pEDA] liu.jun
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 ======如何进行一维周期性体系的结合能、能量分解pEDA======
-BAND的一维是真正的一维体系，不需要加真空，在一维材料外围是无限大的真空，从而使得BAND在精度和计算效率方面均优于平面波程序。由于pEDA分析支持正常k空间布点，而NOCV则只支持Gamma点，因此建议二者分别计算。本文使用AMS2019.301完成。
+BAND的一维是真正的一维体系，不需要加真空，在一维材料外围是无限大的真空，从而使得BAND在精度和计算效率方面均优于平面波程序。**由于pEDA分析支持正常k空间布点，而NOCV则只支持Gamma点，因此建议二者分别计算。**本文使用AMS2019.301以上版本完成。
 =====模型=====
 这里我们跳过了结构优化的步骤。直接给出优化后的结构：
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 =====第二步：设置参数======
-设置参数如下：
+参数设置详细介绍，参考：[[adf:singlepoint_band]]。这里由于研究表面吸附，存在弱键，因此使用色散修正泛函-D3(BJ)。元素较轻，因此DZP基组即可：
-泛函、基组的选择，可以参考[[adf:functional|]]、[[adf:choosebasisset|]]、[[adf:对同一种元素的不同原子指定不同基组|对同一种元素的不同原子指定不同基组]]
+{{ :adf:1d-peda04.png?650 }}
-{{:adf:1d-peda04.png|}}
 体系分成吸附水分子、聚合物2个区，分区方法参考[[adf:creatregion|]]，如下图：
-{{:adf:1d-peda05.png|}}
+{{ :adf:1d-peda05.png?650 }}
 设置K点越大越精确，但计算量也越大：
-{{:adf:1d-peda06.png|}}
+{{ :adf:1d-peda06.png?650 }}
 勾选该选项，即开启pEDA功能
-{{:adf:1d-peda07.png|}}
+{{ :adf:1d-peda07.png?650 }}
 设置完成后，File > Save As，保存任务。
 ======第三步：运行任务======
-提交任务的方式，参考[[adf:maintance|]]
+提交任务的方式，参考[[adf:maintance|]]。如果提交到Linux系统，参考：[[adf:submitfragment_lsf]]
 ======第四步：结果查看======
-查看结果文件，参考[[adf:showresults|]]。
+SCM - Output - Properties > PEDA Energy Terms即可看到能量分解的情况。
+<code>
+   P E D A   E n e r g y   T e r m s
+  -------------------------------------------------------------------
+  PBE                 au           eV     kcal/mol       kJ/mol
+  -------------------------------------------------------------------
-打开*.out文件，点击Properties > PEDA Energy Terms即可看到能量分解的情况。其中△E<sub>int</sub>表示两个分区之间的**结合能**。各项能量的含义，请参考[[adf:peda能量各项的含义|]]。
+ Main bond energy terms
+   E_Pauli  |    0.01221        0.332         7.66         32.0
+   E_disp   |   -0.00221       -0.060        -1.39         -5.8
+   E_elstat |   -0.01050       -0.286        -6.59        -27.6
+   E_orb    |   -0.00982       -0.267        -6.16        -25.8
+            |  ---------    ---------    ---------    ---------
+   E_int    |   -0.01032       -0.281        -6.48        -27.1
+</code>
+其中<color blue>△E<sub>int</sub>表示两个分区之间的**结合能**</color>。其他各项能量的含义，请参考[[adf:peda能量各项的含义|]]。

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