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adf:二维周期性体系的能量分解peda

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adf:二维周期性体系的能量分解peda [2016/03/24 15:48] – [第二步:设置计算参数] liu.junadf:二维周期性体系的能量分解peda [2016/05/18 15:57] (当前版本) – 移除 liu.jun
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-======二维周期性体系的能量分解====== 
- 
-BAND中的二维体系是真正的二维体系,并不需要加真空层。在Main菜单中,Periodicity一栏显示的是Slab。因此BAND对二维、一维体系的计算效率高于VASP等平面波程序。 
- 
-=====第一步:建模====== 
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-如果是石墨烯等片层结构,如果有CIF文件的话,可以直接通过File > Coordinates Import导入到ADFinput中,之后在Main菜单中将Periodicity设置为Slab即可。如果是三维晶体,比如体心立方的铁晶体。那么应该先将CIF文件导入ADFinput中,然后切割成二维体系,切割方法参考[[adf:从三维晶体切割出二维表面|]]。 
- 
-然后点击Edit > Crystal > Generate Super Cell。设置超胞为2*2: 
- 
-{{:adf:2d-peda04.png|}} 
- 
-之后,在表面创建H<sub>2</sub>分子:左键点击窗口下方的H按钮,然后在合适的位置左键点击2次,即创建好H<sub>2</sub>分子: 
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-{{:adf:2d-peda05.png|}} 
- 
-之后可以对键长和键角进行调整,调整方式参考[[adf:精确调整键长_键角_二面角|]]。 
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-======第二步:设置计算参数====== 
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-严格的说,需要先对吸附模型进行结构优化,但本例仅仅为了演示pEDA的功能,因此省去了结构优化,而假定上述得到的结构是优化好的结构。设置参数如下: 
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-{{:adf:2d-peda06.png|}} 
- 
-如果有原子不在Cell范围内,通过Edit > Crystal > Map Atoms to Cell。因为进行pEDA计算的时候,如果有原子不在Cell范围内可能会报错。 
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-将H2和铁表面分成2个区,分区方法参考[[adf:如何创建分区|]],如下图: 
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-{{:adf:2d-peda07.png|}} 
- 
-设置其他参数: 
- 
-{{:adf:2d-peda08.png|}} 
- 
-{{:adf:2d-peda09.png|}} 
- 
  
adf/二维周期性体系的能量分解peda.1458805698.txt.gz · 最后更改: 2016/03/24 15:48 由 liu.jun

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