这是本文档旧的修订版!
1,主面板的参数设置如下图所示:
需要注意:
2,设置温度区间:
如下图:
第一行设置,表示第0步开始,所有的原子,温度稳定为298K,在大约30fs内调整到该温度,之后温度保持不变,即温度变化梯度(dT)为0。
第二行设置,表示从2500步(也就是625fs)开始,温度从前面的298K升高,升温速率达约0.05K/步,这里的398K实际上不起作用,只有升温梯度0.05K/步起作用,一直保持这个速率升温。
第三行设置,表示升温到1万步(也就是2500fs)的时候,温度变为398K左右,之后温度变化速率为0K/步。
第四行设置,表示从1.3万步(也就是3250fs)开始,温度在前面398K的基础上下降,下降速率为0.5K/步,负号表示下降。
总结:如果温度升高或者降低,那么温度设置不起作用,速率起作用,起始温度为当前温度;如果保温,那么温度设置起作用,速率设为0。
如此,得到的温度变化曲线,和上面的设置对照起来看:
为了便于理解,我们用另外一个更适合实际用途的例子来演示设置和结果(该例子,大致的估算了升温、降温的截止时间,以便于在何时的时间内设置保温):
图形界面中的这些设置,会自动更新到对应的*.run文件中,最后这个例子里面,*.run文件中,关于控温这部分的字段为:
cat > tregime.in <<eor #Temperature regimes #start #nzones at1 at2 T1 Tdamp1 dT1 ... 0 1 1 1350 298.0 30.0 0.0 2500 1 1 1350 298.0 30.0 0.05 10000 1 1 1350 750.0 30.0 0.0 13000 1 1 1350 750.0 30.0 -0.5 13900 1 1 1350 298.0 30.0 0.0 eor