1，主面板的参数设置如下图所示：

需要注意：

• 总的步数一定是大于第二步中设置的步数。否则第二步的设置就没有意义了;
• Main这一页里面设置的温度优先级低于Model > Temperature Regime中温度区间里面设置的温度，因此在温度区间里面设置过的温度，则以温度区间的设置为准，没有设置过的时间里面，以Main里面设置的温度为准；
• 之所以选择NVT系综，是因为这个系综对于微观系统的稳定性比较好。并且，虽然是不断变温的过程，但每个温度台阶，实际上都是一个NVT系综。具体可以参考系综简述

2，设置温度区间：

如下图：

第一行设置，表示第0步开始，所有的原子，温度稳定为298K，在大约30fs内调整到该温度，之后温度保持不变，即温度变化梯度（dT）为0。

第二行设置，表示从2500步（也就是625fs）开始，温度从前面的298K升高，升温速率达约0.05K／步，这里的398K实际上不起作用，只有升温梯度0.05K／步起作用，一直保持这个速率升温。

第三行设置，表示升温到1万步（也就是2500fs）的时候，温度变为398K左右，之后温度变化速率为0K／步。

第四行设置，表示从1.3万步（也就是3250fs）开始，温度在前面398K的基础上下降，下降速率为0.5K／步，负号表示下降。

总结：如果温度升高或者降低，那么温度设置不起作用，速率起作用，起始温度为当前温度；如果保温，那么温度设置起作用，速率设为0。

如此，得到的温度变化曲线，和上面的设置对照起来看：

为了便于理解，我们用另外一个更适合实际用途的例子来演示设置和结果（该例子，大致的估算了升温、降温的截止时间，以便于在何时的时间内设置保温）：

两个计算的文件下载