1，主面板的参数设置如下图所示：

需要注意：

• 总的步数一定是大于第二步中设置的步数。否则第二步的设置就没有意义了;
• Main这一页里面设置的温度优先级低于第二步中温度区间里面设置的温度，因此在温度区间里面设置过的温度，则以温度区间的设置为准，没有设置过的时间里面，以Main里面设置的温度为准；
• 之所以选择NVT系综，是因为这个系综对于微观系统的稳定性比较好。并且，虽然是不断变温的过程，但每个温度台阶，实际上都是一个NVT系综。NPT系综不是很合适，具体可以参考系综简述

2，设置温度区间：

如下图：

第一项，表示第0步开始，在几百fs内（也就是该栏红色框内的100表示100fs，是大致的升温或降温时间），温度稳定到298K上——这一项实际上和Main菜单的设置是一致的。如果不一致，实际上是以这里的为准。

第二项，表示从1000步（也就是250fs）开始，在几千fs内（也就是该栏红色框内的1000表示1000fs，是大致的升温或降温时间），温度稳定到2398K。

第三项，表示从10万步（也就是25000fs）开始，在几千fs内，温度降低到1398K。

第四项，表示从20万步（也就是5万fs）开始，在几千fs内，温度降低到298K，之后一直保持该温度，知道设定的模拟步数进行完毕。

Damp数字越大，表示升温越缓慢。但具体多慢，需要测试一下才知道。MD模拟，温度的控制，只是非常粗糙的控制。除非样本的数量越大，控制能够约准确。

建议用户用简单的系统（例如100个水分子），测试一下升温的过程，究竟是怎么样的。模拟的温度变化，在logile中可以看到。在Movie > Properties > Tempertature可以看到温度变化曲线。