这是本文档旧的修订版!
旧版中的RXMOLFRA文件包含每一帧动画中,各种分子的个数信息列表。2021版以后,默认不再生成该文件,需要用户通过一个简单的Python脚本(下载后请解压)生成。
将该脚本放入ams2021.*/scripting/standalone/reaxff-ams/中(当然也可以放入其他地方都可以,执行命令行的时候,输入路径即可)。打开AMSJobs,在AMSJobs窗口进入作业的*.results所在文件夹,然后菜单栏 Help → Command-line 输入sh回车,从而进入脚本环境。通过如下命令,生成该文件:
amspython $AMSHOME/scripting/standalone/reaxff-ams/mols_in_traj.py *.results > RXMOLFRA.txt
其中*替换为作业的名字,RXMOLFRA.txt 是生成的文件。