这是本文档旧的修订版!
旧版中的RXMOLFRA文件包含每一帧动画中,各种分子的个数信息列表。2021版以后,默认不再生成该文件,需要用户通过一个简单的Python脚本(下载后请解压)生成。
将该脚本放入ams2021.*/scripting/standalone/reaxff-ams/中(当然也可以放入其他地方都可以,执行命令行的时候,输入路径即可)。打开ams_command_line.bat,输入sh回车,从而进入脚本环境。然后通过简单的cd命令(如果不熟悉命令用法,请参考Linux/Win shell常用命令),进入作业所在的目录中,通过如下命令,生成该文件:
amspython $AMSHOME/scripting/standalone/reaxff-ams/mols_in_traj.py *.results > RXMOLFRA
其中*替换为作业的名字,RXMOLFRA是生成的文件。