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adf:2021generaterxmolfra

这是本文档旧的修订版!


2021~2022版中,ReaxFF如何生成旧版中的RXMOLFRA文件

旧版中的RXMOLFRA文件包含每一帧动画中,各种分子的个数信息列表。2021版以后,默认不再生成该文件,需要用户通过一个简单的Python脚本(下载后请解压)生成。

使用方法

将该脚本放入ams2021.*/scripting/standalone/reaxff-ams/中(当然也可以放入其他地方都可以,执行命令行的时候,输入路径即可)。打开ams_command_line.bat,输入sh回车,从而进入脚本环境。然后通过简单的cd命令(如果不熟悉命令用法,请参考Linux/Win shell常用命令),进入作业所在的目录中,通过如下命令,生成该文件:

amspython $AMSHOME/scripting/standalone/reaxff-ams/mols_in_traj.py *.results > RXMOLFRA

其中*替换为作业的名字,RXMOLFRA是生成的文件。

adf/2021generaterxmolfra.1689921713.txt.gz · 最后更改: 2023/07/21 14:41 由 liu.jun

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