如何从SMILES生成3-D分子结构

拷贝SMILES,例如P(=O)(c1ccccc1)(c2ccccc2)(c3ccccc3),在AMSinput中Ctrl V粘贴,即可得到3-D分子结构,但需要主要生成的结构,没有考虑异构的问题,只能保证原子的连接方式的正确性。为了得到更准确的结构,用户需要使用Conformer模块进行结构筛选,并使用ADF进行结构优化。具体可以参考:药物分子构象搜索,红外与UV、ECD谱的计算及其玻尔兹曼平均