adf:screenhbd-hba
差别
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| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
| adf:screenhbd-hba [2023/06/09 21:53] – [脚本参数修改] liu.jun | adf:screenhbd-hba [2023/08/21 17:14] (当前版本) – [Windows] liu.jun | ||
|---|---|---|---|
| 行 1: | 行 1: | ||
| - | ======低共熔溶剂批量筛选====== | + | ======溶剂筛选：气体溶质的低共熔溶剂批量筛选====== |
| - | HBA、HBD以一定比例形成低共熔溶剂，本文介绍通过 Python 脚本，批量计算二者以一定比例遍历组合形成的溶剂，用户指定溶质在其中的活度系数（使用无限稀释模型）以及亨利常数。 | + | HBA、HBD以一定比例形成低共熔溶剂，本文介绍通过 Python 脚本，遍历各种HBA、HBD、遍历配比，形成的溶剂中，特定**气体溶质**在其中的活度系数（使用无限稀释模型）以及亨利常数、溶解度。 |
| =====运行环境===== | =====运行环境===== | ||
| ====Windows==== | ====Windows==== | ||
| AMSJobs → Help → Command-line 打开命令行，输入 sh 回车进入命令行环境，筛选作业在该环境中完成，将生成 Excel 结果文件以及图，便于用户进行数据处理。 | AMSJobs → Help → Command-line 打开命令行，输入 sh 回车进入命令行环境，筛选作业在该环境中完成，将生成 Excel 结果文件以及图，便于用户进行数据处理。 | ||
| - | 另外，需要安装 pandas 包。安装方法：在命令行中输入 amspython -m pip install -i https:// | + | 另外，需要安装 pandas 包。安装方法：在命令行中输入 |
| + | < | ||
| + | amspython -m pip install -i https:// | ||
| + | </ | ||
| + | 回车，大约几十秒即可安装成功。 | ||
| - | 如果 HDB、HDA、溶质数量特别巨大，需要并行化处理，则还需要安装 multiprocessing 包，安装方法：在命令行输入 amspython -m pip install multiprocessing 回车。这个包似乎没有找到国内的镜像，因此可能连接国外服务器太慢，导致安装失败。 | + | 如果 HDB、HDA、溶质数量特别巨大（例如上万个），需要并行化处理，则还需要安装 multiprocessing 包，安装方法：在命令行输入 |
| + | < | ||
| + | amspython -m pip install multiprocessing | ||
| + | </ | ||
| + | 回车。这个包似乎没有找到国内的镜像，因此可能连接国外服务器太慢，导致安装失败。 | ||
| ====Linux==== | ====Linux==== | ||
| 在 AMS 环境变量生效的情况下，直接进入命令行即可，当然也需要类似安装 pandas、multiprocessing 包。 | 在 AMS 环境变量生效的情况下，直接进入命令行即可，当然也需要类似安装 pandas、multiprocessing 包。 | ||
| =====准备HDA、HDB、溶质===== | =====准备HDA、HDB、溶质===== | ||
| - | 这要求清楚分子的三维结构，三维结构的确认，参考教程“[[adf: | + | 这要求清楚分子的三维结构，三维结构的确认，参考教程：“[[adf: |
| 得到分子结构后，制备 HDA、HDB、溶质分子的 *.coskf，参考教程： | 得到分子结构后，制备 HDA、HDB、溶质分子的 *.coskf，参考教程： | ||
| 行 51: | 行 58: | ||
| Pvap = np.power(10, | Pvap = np.power(10, | ||
| </ | </ | ||
| - | * 这里 6.35537、2067.0、156.462 是 Antonie equation 中的 A、B、C。用户如果没有相关数据，可以在 NIST 查询，参考[[adf: | + | * 这里 6.35537、2067.0、156.462 是 Antonie equation 中的 A、B、C。用户如果没有相关数据，可以在 NIST 查询，参考：[[adf: |
| < | < | ||
| HBA_to_HBD_ratio = [0.5,1,2] | HBA_to_HBD_ratio = [0.5,1,2] | ||
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| - | * 这表示 HBA:HBD 摩尔比分别为 | + | * 这表示 HBA:HBD 摩尔比将遍历 |
| =====运行方式===== | =====运行方式===== | ||
| - | 在如上命令行环境中，进入脚本所在文件夹（如果 AMSJobs 进入该文件夹，则 Help → Command-line输入sh回车即处于该文件夹下），输入命令： | + | 在如上命令行环境中，进入脚本所在文件夹（如果 AMSJobs 进入该文件夹，则 Help → Command-line 输入 sh 回车即处于该文件夹下），输入命令： |
| < | < | ||
| amspython example9_DES_screening_MPI.py | amspython example9_DES_screening_MPI.py | ||
| 行 64: | 行 71: | ||
| 回车即开始运行。 | 回车即开始运行。 | ||
| =====结果查看===== | =====结果查看===== | ||
| - | 一般很快运行完毕(案例中的文件数量耗时几十秒)，结果在文件夹中，包含不同比例情况下的亨利常数对数比较，以及一个Excel文件，详细列出活度系数、亨利常数、1 bar 下的溶解度（采用公式 x = 1bar/H 计算得到） | + | 一般很快运行完毕(案例中的文件数量耗时几十秒)，结果在文件夹中，包含不同比例情况下的亨利常数对数比较，以及一个 Excel 文件，详细列出活度系数、亨利常数、1 bar 下的溶解度（采用公式 x = 1bar/H 计算得到） |
adf/screenhbd-hba.1686318794.txt.gz · 最后更改: 2023/06/09 21:53 由 liu.jun