adf:potential
差别
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| adf:potential [2016/10/04 10:42] – liu.jun | adf:potential [2020/11/30 17:58] (当前版本) – 移除 liu.jun | ||
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| 行 1: | 行 1: | ||
| - | ======= 如何计算分子的静电势 ====== | ||
| - | 任何一个单点计算，均能自动得到等静电势面。我们以水分子为例，用三种方式来演示静电势面。以下操作均在View窗口。并且都设置了图像的透明度为30%。设置方法参考：[[adf: | ||
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| - | =====静电势的等值面===== | ||
| - | 静电势的等值面，顾名思义，整个曲面上的静电势的值是相等的。也就是我们设置的数值。点击Add > Isosurface。将最前面的框勾选，表示显示该函数。Select Field选择potential > SCF_CoulombPot。输入数值，例如0.13，即看到静电势为0.13的等值面。如下图： | ||
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| - | 注意，因为只有一个值，所以不需要多种颜色来标记静电势的值。 | ||
| - | =====静电势等高线===== | ||
| - | 点击Add > Cutplane: contours。将最前面的框勾选，表示显示该函数。Select Field选择potential > SCF。可以选中三个原子（两个也可以），并点击“with atoms”（窗口底部），从而使得等高线是在三个原子确定的一个平面上，也可以勾选“Position plan”（窗口底部）拖动、转动随之产生的方框来移动等高线的位置和方向。设置关心的库伦势的范围，例如本例中，希望显示库伦势为－0.0675到3.0范围（起始值不一样，可以看到等高线分布的区域也不一样，这样可以观察范围来调整关心的等高线数值范围）的等高线，显示25条。勾选bar，将颜色与数值对照起来，bar的范围就是我们设定的范围，例如本例显示的是－0.0675到3.0的颜色条。如下图所示： | ||
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| - | =====等电子密度面上显示静电势的分布===== | ||
| - | 这是为了显示在电子密度等值面上，通过颜色来标记在该等值面上，静电势的分布情况。第一个Select Field选择Density > SCF，后面的数值是电子密度等值面的数值，例如当前的曲面是电子密度为0.03的等值面，第二个Select Field选择potential > SCF，表示在电子密度为0.03的曲面上显示该曲面的静电势。勾选最后面的bar，显示颜色条。这里不需要设置静电势的范围，因为曲面已经选定好了，静电势的范围就是确定的了。如下图所示： | ||
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| - | 当然，事实上第一个等值面也可以是其他函数的等值面。 | ||
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| - | =====用颜色显示切面上的静电势分布===== | ||
| - | 点击Add > Cutplane: colcored。将最前面的框勾选，表示显示该函数。Select Field选择potential > SCF。可以选中三个原子（两个也可以），并点击“with atoms”（窗口底部），从而使得等高线是在三个原子确定的一个平面上，也可以勾选“Position plan”（窗口底部）拖动、转动随之产生的方框来移动等高线的位置和方向。设置关心的库伦势的范围，例如本例中，希望显示库伦势为－0.0675到3.0范围（。勾选bar，将颜色与数值对照起来，bar的范围就是我们设定的范围，例如本例显示的是－0.0675到1.0的颜色条。如下图所示： | ||
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adf/potential.1475548972.txt.gz · 最后更改: 2016/10/04 10:42 由 liu.jun