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adf:ewall

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adf:ewall [2019/12/11 11:21] – [参数设置] liu.junadf:ewall [2022/12/27 09:55] (当前版本) – [在ReaxFF中设置阻碍原子穿越的弹性墙壁] liu.jun
行 1: 行 1:
 ======在ReaxFF中设置阻碍原子穿越的弹性墙壁====== ======在ReaxFF中设置阻碍原子穿越的弹性墙壁======
 +**以下内容针对2019.3之前的版本。**2022以后的版本参考[[adf:applywallpotential]]
  
-ReaxFF增加了一个功能,允许用户指定一个弹性墙壁,原子穿越该墙壁,需要较高能量,用户可以设置墙壁的宽度、高度(以能量为单位)。原子撞击到墙壁的时候会被弹回,但墙壁本身不是由原子组成,就是一个纯粹的势垒而已。+ReaxFF允许用户指定一个弹性墙壁,原子穿越该墙壁,需要较高能量,用户可以设置墙壁的宽度、高度(以能量为单位)。原子撞击到墙壁的时候会被弹回,但墙壁本身不是由原子组成,就是一个纯粹的势垒而已。
  
 =====参数设置===== =====参数设置=====
行 11: 行 12:
 {{ :adf:ewall00_2.png?650 }} {{ :adf:ewall00_2.png?650 }}
  
-<color blue>之后,修改晶格为35*35*35埃<sup>3</sup>,</color>ADFinput > View > Axis显示坐标,<color blue>可以看到水分子集中在-15~15埃之间,xyz方向均如此(这很重要,因为设置墙壁的坐标和这个坐标是匹配的),</color>如下图所示:+<color blue>之后,修改晶格为35*35*35埃<sup>3</sup>,</color>ADFinput > View > Axis显示坐标**(请务必显示坐标轴,免得弄错原子的坐标范围)**,<color blue>可以看到水分子所有原子的坐标集中在-15~15埃之间,xyz方向均如此(这很重要,因为设置墙壁的坐标和这个坐标是匹配的),</color>如下图所示:
  
 {{ :adf:ewall02.png?650 }} {{ :adf:ewall02.png?650 }}
行 36: 行 37:
 表示在垂直于x轴,在垂直于x=-17.5的位置,有一个“墙壁”,厚度为2.5埃(由于30埃增加了5埃,这5埃就是墙的厚度),高度为300.0kcal/mol。这个值越大,原子越难以穿越。 表示在垂直于x轴,在垂直于x=-17.5的位置,有一个“墙壁”,厚度为2.5埃(由于30埃增加了5埃,这5埃就是墙的厚度),高度为300.0kcal/mol。这个值越大,原子越难以穿越。
  
-<color blue>不要照搬上述数值。理解其意义后,在根据自己的实际情况设置数值。</color>+**<color blue>不要照搬上述数值。理解其意义后,在根据自己的实际情况设置数值,墙的高度300kcal/mol可以设置的较为随意,例如保险起见设置很大:1000kcal/mol。</color>**
 =====注意===== =====注意=====
   - 确保没有分子在墙里面。   - 确保没有分子在墙里面。
adf/ewall.1576034499.txt.gz · 最后更改: 2019/12/11 11:21 由 liu.jun

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