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adf:adfviewcalculate

View中如何进行函数的加减等运算

这里以减法为例,软件版本为AMS2019.301。

SCM LOGO > View,弹出View窗口。点击Field > Calculated,窗口底部Select Field区域,分别选择需要运算的函数,例如如下图所示,选择Density - Density SCF(当前二聚体电子密度),以及Density - Density Sum Frag(孤立碎片电子密度简单叠加),将进行二者的减法运算。

其中减号可以选择为其他运算符号。

此时注意,“Density SCF - Density Sum Frag” 这个新函数的名称为C-1(窗口左下角)。

新函数的显示

新函数的显示就与其他函数的显示方法是完全一样的。由于此处的相减生成的结果是有正负相位的,因此Add - Isosurface:with phase,之后底部Select Field窗口选择other - “C-1”,同时修改等值面的值,使得图像更方便查看,因此改为0.01。如下图所示:

为了更方便观察电子密度与原子核的位置,我们把C-1函数用半透明的方式显示:点击窗口底部的Isosurface: With Phase按钮 - Show details,然后将下图所示的位置,默认100改为40(值越小透明度越低,100为不透明,0为完全透明)。

图中红色与蓝色,表示电子的流向。其中蓝色区域表示正值(本例中表示得到了电子),红色区域表示负值(本例中表示失去了电子)。

adf/adfviewcalculate.txt · 最后更改: 2024/05/30 09:58 由 liu.jun

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